Наука о подземных водах в Ленинградском государственном университете как новое научное направление сформировалась в начале ХХ в. В 1930 г. на географическом факультете была образована кафедра подземных вод, которой в 1930-1934 г. г. заведовал Борис Леонидович Личков, ученик и сподвижник В.И. Вернадского. В результате реорганизации университета в соответствии с постановлением коллегии Наркомпроса РСФСР от 28.04.1931 кафедра подземных вод была ликвидирована, однако в географическом секторе сохранилась специальность «Гидрология», где проф. Б. Л. Личков читал полный курс «Подземные воды». В сентябре 1932 г. сектора были преобразованы в отделения. В этот же год был существенно увеличен прием студентов на специальность «Гидрология». В октябре 1932 г. на географическом отделении были возрождены кафедры и в том числе кафедра «Подземных вод», заведующим которой был назначен Б. Л. Личков, однако в мае 1933 г. ее аннулировали, согласно новому списку кафедр, утвержденному Наркомпросом.

В первой половине 30-х г. г. на кафедре гидрологии началась дифференцированная подготовка специалистов-гидрологов (океанологи, речники, комплексники, подземники). «Подземниками» называли студентов специальности «Гидрология подземных вод», их учебная программа вместила целый ряд геологических дисциплин. Одним из преподавателей был С. С. Кузнецов.

Борис Леонидович Личков отличался широким планетарным мышлением, увлекавшийся глобальными проблемами Земли и подземной гидросферы. Его по праву считают основоположником научной школы гидрогеологов Ленинградского университета, доктор геолого-минералогических наук (1942), почётный член Географического общества был арестован по надуманному делу в январе 1934 г., осужден, сидел, полностью реабилитирован в 1956 г.

28 сентября 1936 г. на геолого-почвенно-географическом факультете образована кафедра гидрогеологии, в состав первых преподавателей вошли бывшие студенты Б. Л. Личкова, закончившие университет по специальности «Гидрология подземных вод» (В. А. Сергеев, Н. Я. Верхало-Узкий и Е. А. Ансберг). Заведовать кафедрой стал С. С. Кузнецов, благодаря стараниям которого была создана хорошая материальная база кафедры - гидрогеологическая лаборатория, библиотека с обменным фондом, организован научный кружок.

В 1945 г. возвращается в Ленинград Б. Л. Личков и занимает должность заведующего кафедрой гидрогеологии, которой он заведует вплоть до 1965 г. Борис Леонидович - основатель научной школы «О роли подземной гидросферы в истории Земли», заложившей фундамент школы гидрогеологов Ленинградского университета. Основные положения школы изложены в его монографиях - «К основам современной теории Земли» (1965 г.) и «Природные воды Земли и литосфера» (1960 г.), которые до сих пор не потеряли своего значения. При Борисе Леонидовиче на кафедре появилась молодая талантливая молодежь (М. А.  Мартынова, Г. И.  Мартьянова, О. Н. Собакин, Э. В. Козлова, Е. В. Часовникова). В 1961 г. в НИИ Земной коры, созданном при геологическом факультете ЛГУ в 1936 г., была организована лаборатория гидрогеологии, первым руководителем которой стал докт. геол.-мин. наук А.Е. Ходьков. Это было время интенсивного развития гидрогеологии при тесном взаимодействии сотрудников лаборатории и кафедры.

В 1964 году кафедра гидрогеологии была объединена с кафедрой грунтоведения. Объединенной кафедрой заведовал А. К. Ларионов. Это продолжалось около двух лет до 1967 г., когда усилиями Анатолия Константиновича обе кафедры смогли восстановить самостоятельный статус. С 1967 по 1969 г. г. и.о. заведующего кафедрой гидрогеологии стал М. И. Врублевский – специалист по минеральным водам.

С 1969 по 1984 г. г. заведование кафедрой принял на себя Г. В. Короткевич. Он значительно расширил круг научных направлений кафедры, которые охватывали широкий круг вопросов относящихся к карсту, инженерной гидрогеологии, динамики подземных вод. При Г. В. Короткевиче возникло и окрепло гидрогеоэкологическое направление (связанное с рациональным использованием ресурсов гидроминерального сырья), изучались проблемы современного и древнего галогенеза, особенности образования и рационального освоения солеродных бассейнов. В центре научной деятельности Георгия Васильевича - соляной карст (механизмы выветривания и растворения каменной соли в естественных условиях).

В этот же период на кафедре работает группа В. С. Самариной, которая проводит региональные исследования в Таджикистане; результаты их работы вошли в монографию «Гидрогеология СССР» (том 41 «Таджикистан»). В этих работах участвовали многие специалисты кафедры, аспиранты и студенты. Со студенческой скамьи до 1982 г. жизнь В. С. Самариной была связана с кафедрой гидрогеологии, пока трагические обстоятельства не вынудили ее оставить университет.

В 1984 г. кафедру возглавил д.г.-м.н., профессор А.Н. Воронов, который руководил кафедрой четверть века вплоть до 2009 г., когда его сменил П. К. Коносавский. За годы заведования А. Н. Воронов, обладая великолепным организаторским талантом, привлек на кафедру целый ряд первоклассных специалистов, создал при кафедре гидрогеологии новые лаборатории. На кафедре стали развиваться новые направления, такие как нефтегазовая гидрогеология, экология водных ресурсов, геохимия радиоактивных газов в подземных водах, водный менеджмент, гидрогеологические проблемы разработки полезных ископаемых. При А. Н. Воронове установилось тесное сотрудничество с гидрогеологами Польши, Ирландии, Италии, США, Южной Кореи, Франции, Египта и др.; проведены три международные конференции (1993, 1997, 2002 г.г.).

С 1990 по 2000 г.г. на кафедре гидрогеологии работал д.г.-м.н., профессор, член-корр. АН СССР В. А. Мироненко, который возглавлял Санкт-Петербургское Отделение института геоэкологии РАН и Межфакультетский научный центр «Гидрогеоэкология» СПбГУ. После трагической смерти Валерия Александровича его место занял профессор кафедры д.г.-м.н. Вячеслав Гениевич Румынин. В 1997 г. была открыта лаборатория изотопов природных флюидов, возглавляемая профессором Э. М. Прассоловым; в 2003 г. - лаборатория радиационного контроля подземных вод, возглавляемая Е. П. Каюковой.

В период заведования П. К. Коносавского (2009-2018 г.г.) тематика научно-практических работ кафедры пополнилась новыми направлениями: горнопромышленная гидрогеология, методика математического (численного) моделирования в гидрогеодинамике и геомиграции, гидрогеологические изыскания при промышленном и гражданском строительстве. В сотрудничестве с НИЦ «Гидрогеология» и СПбО ИГЭ РАН проводился обширный комплекс совместных прикладных исследований, базирующихся на традиционных и инновационных наукоемких полевых и информационных технологиях.

В настоящее время исполняющим обязанности заведующего кафедрой гидрогеологии является С. Б. Бурлуцкий.

Развернутый очерк об истории кафедры