Учение о полезных ископаемых в тех или иных формах преподавались в университете с момента образования геологического факультета в 1932 году. Однако, как отдельное направление подготовки специалистов, оно оформилось в кабинете полезных ископаемых кафедры минералогии, организованном Г.Н.Бунтиным в 1939 году. В 1945 году на базе этого кабинета была организована кафедра полезных ископаемых под руководством профессора Константина Николаевича Озерова.
В 1950 году для подготовки геологов, необходимых для бурно развивающейся атомной промышленности, была создана кафедра месторождений радиоактивных элементов («Геохимии 2») под руководством профессора Николая Георгиевича Судовикова.
В 1973 году две кафедры объединены в одну под названием кафедра геологии месторождений полезных ископаемых.